5. turun bitmesiyle birlikte gruplara kalan 19 takımın yanı sıra, Galatasaray, Fenerbahçe, Beşiktaş, Trabzonspor ve Başakşehir de doğrudan grup kura çekimine dahil oldu.
TFF Başkan Vekili Mecnun Otyakmaz kura öncesi yaptığı açıklamada, "Fenerbahçe'den Türkiye Kupası için henüz ulaşan bir karar olmadığı için biz rutini bozmadan kura çekimini yapacağız." dedi.
Formata göre grup müsabakalarına katılan 24 takım sıralandıktan sonra 1-8 arasında yer alan takımlar 1. torbayı, 9-16 2. torbayı, 17-24 ise 3. torbayı oluşturdu. Her torbada yer alan 8 takım 4 gruba eşit olarak dağıtıldı. Gruplarda 3 torbadan ikişer takım olmak üzere 6 takım yer aldı.
Orhan Saka Konferans Salonu'nda gerçekleştirilen kura çekiminin ardından Türkiye Kupası'nda oluşan gruplar şöyle:
A Grubu: Trabzonspor, Alanyaspor, Rizespor, MKE Ankaragücü, Fatih Karagümrük, İskenderunspor
B Grubu: Fenerbahçe, Kasımpaşa, Gaziantep FK, Göztepe, İstanbulspor, Erzurumspor FK
C Grubu: Galatasaray, Başakşehir, Konyaspor, Eyüpspor, Çorum FK, Boluspor
D Grubu: Beşiktaş, Sivasspor, Antalyaspor, Bodrum FK, Kocaelispor, Kırklarelispor
Grupların ardından belli olan fikstüre göre Trabzonspor, Türkiye Kupası A Grubu'nda 3 maçının 2'sini iç sahada oynayacak. Fenerbahçe, B Grubu'nda 3 maçının 2'sini deplasmanda oynayacak.
Galatasaray C Grubu'nda 3 maçının 2'sini iç sahada oynarken Beşiktaş D Grubu'nda 3 maçının 2'sini deplasmanda oynayacak.
Grup aşamasında ilk maçlar 7-8-9 Ocak, ikinci maçlar 4-5-6 Şubat, üçüncü ve son maçlar ise 25-26-27 Şubat 2025 tarihlerinde oynanacak.
Gruplarında ilk iki sırayı alan toplam 8 takım çeyrek finale kalmaya hak kazanacak.
Kupada final mücadelesi ise 14 Mayıs 2025'te gerçekleştirilecek.